Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms