Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ciao1Q99KN2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms