Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn2aQ99KJ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms