Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc8b1Q925Q3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms