Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfdQ925I7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms