Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prss28Q924N9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prss28Q924N9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms