Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubb6Q922F4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb6Q922F4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms