Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q4

Vps16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps16Q920Q4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps16Q920Q4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps16Q920Q4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps16Q920Q4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms