Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Odf3Q920N1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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