Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpf6Q91YR7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prpf6Q91YR7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpf6Q91YR7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms