Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Synpo2Q91YE8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Synpo2Q91YE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms