Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcdhb12Q91Y07 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms