Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Setd3Q91WC0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Setd3Q91WC0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms