Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms