Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps3Q91VB4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms