Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms