Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mark1Q8VHJ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mark1Q8VHJ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms