Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgbl1Q8VDV0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgbl1Q8VDV0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgbl1Q8VDV0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgbl1Q8VDV0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgbl1Q8VDV0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgbl1Q8VDV0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms