Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cbx7Q8VDS3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms