Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgip1Q8VD37 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sgip1Q8VD37 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sgip1Q8VD37 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sgip1Q8VD37 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sgip1Q8VD37 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms