Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mterf3Q8R3J4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms