Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f4Q8R0K9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f4Q8R0K9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f4Q8R0K9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms