Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin28aQ8K3Y3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin28aQ8K3Y3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin28aQ8K3Y3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms