Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ndufs8Q8K3J1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms