Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MyripQ8K3I4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MyripQ8K3I4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MyripQ8K3I4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms