Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdk5rap2Q8K389 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk5rap2Q8K389 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms