Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf39Q8K2Z2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpf39Q8K2Z2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms