Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Txndc11Q8K2W3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Txndc11Q8K2W3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Txndc11Q8K2W3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms