Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc12Q8K2L8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms