Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6bQ8K2H2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Otud6bQ8K2H2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms