Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkd3Q8K1Y2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms