Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek9Q8K1R7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek9Q8K1R7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek9Q8K1R7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms