Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LgsnQ8CIX8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LgsnQ8CIX8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms