Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prmt5Q8CIG8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prmt5Q8CIG8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms