Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHH9

Sept8, Septin-8, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept8Q8CHH9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept8Q8CHH9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept8Q8CHH9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept8Q8CHH9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms