Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc43a2Q8CGA3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc43a2Q8CGA3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms