Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp11Q8CFF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp11Q8CFF0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms