Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8CF25 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8CF25 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8CF25 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8CF25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8CF25 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8CF25 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8CF25 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8CF25 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8CF25 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8CF25 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8CF25 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8CF25 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8CF25 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CF25 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8CF25 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms