Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms