Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm9955Q8CEJ8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms