Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atad2Q8CDM1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atad2Q8CDM1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms