Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fbxo48Q8CAT8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fbxo48Q8CAT8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Fbxo48Q8CAT8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fbxo48Q8CAT8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms