Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9958Q8C9U4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9958Q8C9U4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms