Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp20Q8C6M1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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