Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc113Q8C5T8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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