Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrd1Q8C0R9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrd1Q8C0R9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrd1Q8C0R9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrd1Q8C0R9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms