Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkrfQ8BY02 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NkrfQ8BY02 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms