Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms