Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp2Q8BX07 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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