Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm4aQ8BW72 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms