Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms